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ISSN: 2333-9721
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Taxonomy and Characterization of Fungi Isolated from Cocoa Beans during Fermentation in Saf’s Agroforestry System in the Amazon

DOI: 10.4236/oalib.1108825, PP. 1-10

Subject Areas: Developmental Biology, Microbiology, Biotechnology, Agricultural Science

Keywords: Molecular Analysis, Cocoa Beans, Endophytic Fungi

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Abstract

Agroforestry systems (SAFs) are an alternative for sustainable development as they enable the recovery of degraded areas and reduce deforestation, contributing to breaking the cycle of traditional family farming, so common in the Amazon region, which enables the recovery of soils, the increase of organic matter and soil fertility. Cocoa beans are grown and fermented in SAFs. According to the research, the significant appearance of endophytic microorganisms such as fungi in the cocoa bean can benefit its fermentative and cocoa production. The aim of the study was to characterize the fungi microbiota of cocoa beans during the fermentation and drying process. Fungi isolation was performed from the collected samples, and one of the applied procedures was the scraping of the dried. Afterwards, aliquots were subcultured in a Petri dish with a culture medium containing Potato dextrose ágar cultures were analyzed by counting colony-forming. DNA sequencing and phylogenetic analyses were performed to emphasize microbial characterization. The species found in this study: Geotrichum candidum and Galactomyces geotrichum are endophytic fungi. On the other hand, Ascomycota sp. and Cladosporium cladosporioides are environment fungi. However, this work contributed to the characterization of endophytic fungi.

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Barros, M. C. , Quadros, J. S. , Silva, M. A. P. D. and Nunes, R. S. C. (2022). Taxonomy and Characterization of Fungi Isolated from Cocoa Beans during Fermentation in Saf’s Agroforestry System in the Amazon. Open Access Library Journal, 9, e8825. doi: http://dx.doi.org/10.4236/oalib.1108825.

References

[1]  Brasil. Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE) and Sistema de IBGE de Recuperação Automática (SIDRA) (2021) Levantamento Sistemático da Produção Agrícola. https://sidra.ibge.gov.br/home/lspa/brasil
[2]  Brainer, M.S.C.P. (2021) Produção de cacau. Banco do Nordeste do Brasil, Fortaleza.
[3]  Paraense, V., Mendes, F.A. and Freitas, A. (2013) Avaliação econômica de sistemas agroflorestais de cacau e mogno na transamazônica: Um estudo de caso. Enciclopédia Biosfera, 9, 2754-2764.
[4]  De Oliveira, P.K., Ferraz, P. and Dornelles, M. (2018) Segmentação de amêndoas de cacau em imagens digitais de tabuas de corte. In: Escola Regional de Computação Bahia, Alagoas e Sergipe (ERBASE), Sociedade Brasileira de Computação, Porto Alegre, 357-365.
[5]  de Souza, D.R., de Souza, G.A., de Araujo, I.F.B., et al. (2017) Efeitos tóxicos dos fungos nos alimentos. Revinter, 10, 73-84. https://doi.org/10.22280/revintervol10ed2.281
[6]  Sousa, I.M., Nascente, A.S. and De Fillipi, M.C.C. (2019) Bactérias promotoras do crescimento radicular em plantulas de dois cultivares de arroz irrigado por inundação. Colloquium Agrariae, 15, 140-145. https://doi.org/10.5747/ca.2019.v15.n1.a293
[7]  Levy, C.E. (2004) Detecção e identificação dos fungos de importancia médica. In: Manual de Microbiologia Clínica para o controle de infecção em serviços de saúde, Agência Nacional de Vigilancia Sanitária, Brasília, 1-27.
[8]  Brasil. Agência Nacional de Vigilancia Sanitária (ANVISA) (2004) Descrição dos meios de cultura empregados nos exames microbiológicos. Brasília.
[9]  Oliveira, J.O., Vilela, L.T.O., Silva, L.H.O., Nascimento, T.S., Magalhães, F.A.C. and Vivi, V.K. (2017) Análise Microbiológica de Especiarias Desidratadas Comercializadas em Feiras Livres de Cuiabá, Mato Grosso. Journal Health NPEPS, 2, 365-379.
[10]  Menezes, G.S. (2017) Aplicações biotecnológicas de fungos micorrízicos e fitopatogênicos na agricultura. Universidade Federal de Sergipe, São Cristóvão.
[11]  Mariano, R.L.R. and Souza, E.B. (2016) Manual de Práticas em Fitobacteriologia. 3a Edição Revisada e Ampliada, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.
[12]  Larkin, M.A., Blackshields, G., Brown, N.P., Chenna, R., Mcgettigan, P.A., Mcwilliam, H., Valentin, F., Wallace, I.M., Wilm, A., Lopez, R., Thompson, J.D., Gibson, T.J. and Higgins, D.G. (2007) Clustal W and Clustal X Version 2.0. Bioinformatics, 23, 2947-2948. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm404
[13]  Sneath, P.H.A. and Sokal, R.R. (1973) Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean. Numerical Taxonomy. Freeman, San Francisco, CA.
[14]  Alper, I., Frenette, M. and Labrie, S. (2013) Genetic Diversity of Dairy Geotrichum candidum Strains Revealed by Multilocus Sequence Typing. Applied Microbiology and Biotechnology, 97, 5907-5920. https://doi.org/10.1007/s00253-013-4776-2
[15]  Hoog, G.S., Smith, M.T. and Guéro, E. (1998) Dipodascus de Lagerhein. In: Kurtzman, C.P. and Fell, J.W., Eds., The Yeast: A Taxonomic Study. Elsevier, Amsterdam, 181-193. https://doi.org/10.1016/B978-044481312-1/50033-2
[16]  Gente, S., Sohier, D., Coton, E., Duhamel, C. and Guéguen, M. (2006) Identification of Geotrichum candidum at the Species and Strain Level: Proposal for a Standardized Protocol. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 33, 1019-1031. https://doi.org/10.1007/s10295-006-0130-3
[17]  Almeida, S.F.O. (2018) Leveduras da fermentação do cacau amazônico: Caracterização molecular e perfil de enzimas extracelulares. Tese de Doutorado em Ciência e Tecnologia de Alimentos, Universidade Federal do Pará, Belém.
[18]  Dias, A.M. (2016) Sucessão microbiana durante a fermentação espontanea do cacau para caracterização e isolamento de linhagem starter. 2016. 43 f Orientadora: Rachel Passos Rezende Dissertação de Mestrado em Genética e Biologia Molecular. Universidade Estadual de Santa Cruz, Ilhéus.
[19]  Junior Chagas, A.F., Godoy, V.H.S., Miller, L.O. and Carvalho Filho, M.R. (2016) Bioprospecção de Trichoderma spp. sobre o crescimento micelial de Colletotrichum cliviae e C. truncatum. Revista Brasileira de Biociências, 14, 238-242.
[20]  Florindo, R.H.S. (2019) Bioprospecção de metabólitos secundários bioativos produzidos por fungos endofíticos associados à Piper sp. coletada no Parque Estadual do Rio Doce, Minas Gerais. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia), Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto.
[21]  Mandlaa, Zhang, Y., Wan, Y., Tie, Y., Zhang, B., Wang, R. and Wang, G. (2019) Isolation and Characterization of Endophytic Fungi from Purslane and the Effects of Isolates on the Growth of the Host. Advances in Microbiology, 9, 438-453. https://doi.org/10.4236/aim.2019.95026
[22]  Angelico, C.L. (2012) Aplicação do agente biológico Cladosporium cladosporioides (Fresen) de Vries “Cladosporin” como bioprotetor da qualidade do café (Coffea arabica L.). Tese de Doutorado em Ciência dos Alimentos, Universidade Federal de Lavras, Lavras.

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