丹参WRKY家族成员TRANSPARENT TESTA GLABRA2（TTG2）基因克隆与生物信息学分析
Bioinformatics and expression analysis of WRKY family member TRANSPARENT TESTA GLABRA2（TTG2）from Salvia miltiorrhiza Bunge

从丹参转录组数据库中克隆得到丹参WRKY家族成员TRANSPARENT TESTA GLABRA2（TTG2）基因（命名为SmTTG2(Genbank注册号: KC161227)），该基因包含一个长为1 425 bp的完整开放读码框，编码475个氨基酸，DNA水平上包含3个内含子。序列分析显示，SmTTG2编码蛋白具有2个WRKY结构域和C2H2结构，属于I类WRKY家族成员，并且与黄瓜、怪柳等物种WRKY44高度相似。软件预测SmTTG2相对分子量为51.28 kDa，等电点为8.58，且其在胞内不稳定，不具跨膜结构。利用DNA步移技术克隆获得SmTTG2基因5′侧翼区序列，分析结果显示该区域除了含有TATA box和CAAT box外，还包含应答环境因子和植物激素的、调节植物发育的顺式作用元件以及MYB转录因子结合位点。实时荧光定量PCR结果表明，SmTTG2基因在丹参花中表达量最高，且随着花期显示出逐步增高的趋势；另外SmTTG2基因的表达伴随丹参种子萌发过程，提示SmTTG2基因可能参与种子的发育和萌发过程