%0 Journal Article %T 丹参WRKY家族成员TRANSPARENT TESTA GLABRA2(TTG2)基因克隆与生物信息学分析<br>Bioinformatics and expression analysis of WRKY family member TRANSPARENT TESTA GLABRA2(TTG2)from Salvia miltiorrhiza Bunge %A 杨树 %A 陈尘 %A 王喆之 %J 陕西师范大学学报自然科学版 %D 2017 %R 1672-4291(2017)04-0079-08doi:10.15983/j.cnki.jsnu.2017.04.344 %X 从丹参转录组数据库中克隆得到丹参WRKY家族成员TRANSPARENT TESTA GLABRA2(TTG2)基因(命名为SmTTG2(Genbank注册号: KC161227)),该基因包含一个长为1 425 bp的完整开放读码框,编码475个氨基酸,DNA水平上包含3个内含子。序列分析显示,SmTTG2编码蛋白具有2个WRKY结构域和C2H2结构,属于I类WRKY家族成员,并且与黄瓜、怪柳等物种WRKY44高度相似。软件预测SmTTG2相对分子量为51.28 kDa,等电点为8.58,且其在胞内不稳定,不具跨膜结构。利用DNA步移技术克隆获得SmTTG2基因5′侧翼区序列,分析结果显示该区域除了含有TATA box和CAAT box外,还包含应答环境因子和植物激素的、调节植物发育的顺式作用元件以及MYB转录因子结合位点。实时荧光定量PCR结果表明,SmTTG2基因在丹参花中表达量最高,且随着花期显示出逐步增高的趋势;另外SmTTG2基因的表达伴随丹参种子萌发过程,提示SmTTG2基因可能参与种子的发育和萌发过程 %K 丹参 %K SmTTG2 %K 生物信息学分析 %K 表达模式 %U http://www.xuebao.snnu.edu.cn/show.aspx?t=zr&DID=4547