白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析
Bioinformatic Analysis of Serine Hydroxymethyltransferase(SHMT) Gene in Bletilla striata

丝氨酸羟甲基转移酶（SHMT）是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一，研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因（NCBI登录号：MG544187），运用生物信息学软件对该基因进行序列分析。结果显示：该基因长度为1 953 bp，编码的蛋白质长度为471aa、分子量为51.861 06 kD、理论等电点为7.17，SHMT二级结构主要由无规则卷曲结构和α螺旋结构组成，核苷酸和氨基酸序列与铁皮石斛SHMT相似性最高，达93%，结构域分析发现该蛋白具有高度保守结构域，三级结构预测为四聚体结构，跨膜区及信号肽分析发现该蛋白无跨膜区及信号肽，亚细胞定位分析发现该蛋白主要位于细胞质、叶绿体亚细胞器位置。本分析结果为白及SHMT的应用研究提供了基础数据，也为植物SHMT基因的分子研究提供了理论依据及基础资料。