%0 Journal Article %T 白及丝氨酸羟甲基转移酶(<i>SHMT</i>)基因的序列分析<br>Bioinformatic Analysis of Serine Hydroxymethyltransferase(<i>SHMT</i>) Gene in <i>Bletilla striata</i> %A 沈访 %A 李林 %A 潘胤池 %A 张社波 %A 马激 %A 徐德林< %A br> %A SHEN Fang %A LI Lin %A PAN Yin-Chi %A ZHANG She-Bo %A MA Ji %A XU De-Lin %J 植物研究 %D 2018 %R 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.04.008 %X 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一,研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因(NCBI登录号:MG544187),运用生物信息学软件对该基因进行序列分析。结果显示:该基因长度为1 953 bp,编码的蛋白质长度为471aa、分子量为51.861 06 kD、理论等电点为7.17,SHMT二级结构主要由无规则卷曲结构和α螺旋结构组成,核苷酸和氨基酸序列与铁皮石斛SHMT相似性最高,达93%,结构域分析发现该蛋白具有高度保守结构域,三级结构预测为四聚体结构,跨膜区及信号肽分析发现该蛋白无跨膜区及信号肽,亚细胞定位分析发现该蛋白主要位于细胞质、叶绿体亚细胞器位置。本分析结果为白及SHMT的应用研究提供了基础数据,也为植物SHMT基因的分子研究提供了理论依据及基础资料。<br %K 白及 %K 丝氨酸羟甲基转移酶 %K 序列分析 %K 结构预测 %K < %K br> %K < %K i> %K Bletilla striata< %K /i> %K serine hydroxymethyl transferase %K sequence analysis %K structure prediction %U http://bbr.nefu.edu.cn/CN/abstract/abstract3718.shtml