犬冠状病毒v1株膜蛋白基因的克隆与序列分析

根据genbank中报道的ccvinsavc-1株核蛋白基因(m)序列,用特异性引物对分离的ccvv1野毒株进行了rt-pcr扩增,将扩增得到的pcr片段纯化后与pgem-t连接得到重组质粒ptm,并进行了核苷酸序列测定。结果表明,该基因全长为789bp,编码263个氨基酸,其中前17个氨基酸为信号肽。与ccv标准毒株insavc-1m基因相比,两者核苷酸的同源性为92.1%;推导的氨基酸序列同源性为90.9%,差异主要发生在该蛋白的n端前1/3区域内。在推导的m蛋白氨基酸序列中,发现了3个明显的疏水区,提示该蛋白可能是一个反复跨膜的蛋白;在n端15～17,38～40,234～236位氨基酸存在3个潜在的n-联糖基化位点,可能是形成该蛋白表面抗原决定基的位点。另外,推导蛋白氨基酸序列的疏水性和抗原表位与insavc-1株m蛋白存在一定差异,提示两者免疫原性可能有差别。