大片吸虫组织蛋白酶l全长序列的获取及其生物信息学分析

？根据文库载体序列与原组织蛋白酶表达序列标签（est）设计引物，以大片吸虫cdna文库为模板，进行touchdownpcr与梯度pcr相结合的扩增反应,扩增产物克隆入pmd18-t载体,经鉴定后测序，并采用生物信息学技术对序列进行开放阅读框（orf）、编码氨基酸序列、蛋白质同源性比较、二级、三级结构等分析；结果所获序列全长990bp,编码330个氨基酸，分子量36771.2u，等电点5.44；具有较明显的螺旋、片层和无规卷曲等二级结构,α螺旋占17.3%,β折叠占27.0%,无规卷曲占55.8%；具有2个较明显的跨膜区和2个疏水区，未发现明显的信号肽和糖基化位点；氨基酸序列同源性比对显示其属于半胱氨酸家族；三级结构同源建模预测显示其与组织蛋白酶k（pdbnumber2f7da）有49%的一致性。