%0 Journal Article %T 大片吸虫组织蛋白酶l全长序列的获取及其生物信息学分析 %A 罗洪林 %A 张为宇 %A 黄维义 %J 牲畜兽医学报 %P 206-211 %D 2008 %X ?根据文库载体序列与原组织蛋白酶表达序列标签(est)设计引物,以大片吸虫cdna文库为模板,进行touchdownpcr与梯度pcr相结合的扩增反应,扩增产物克隆入pmd18-t载体,经鉴定后测序,并采用生物信息学技术对序列进行开放阅读框(orf)、编码氨基酸序列、蛋白质同源性比较、二级、三级结构等分析;结果所获序列全长990bp,编码330个氨基酸,分子量36771.2u,等电点5.44;具有较明显的螺旋、片层和无规卷曲等二级结构,α螺旋占17.3%,β折叠占27.0%,无规卷曲占55.8%;具有2个较明显的跨膜区和2个疏水区,未发现明显的信号肽和糖基化位点;氨基酸序列同源性比对显示其属于半胱氨酸家族;三级结构同源建模预测显示其与组织蛋白酶k(pdbnumber2f7da)有49%的一致性。 %K 大片吸虫 %K 组织蛋白酶l %K 生物信息学 %U http://118.145.16.233/Jweb_xmsy/CN/abstract/abstract9300.shtml