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ISSN: 2333-9721
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G/11木聚糖酶最适pH值的预测及其与氨基酸位置的关系

DOI: 10.11830/ISSN.1000-5013.2014.03.0316

Keywords: 木聚糖酶, 氨基酸, 支持向量机, BP神经网络, 均匀设计, 主成分分析

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Abstract:

把木聚糖酶全序列均分为N端,中间端(I端)及C端3个部分,并分别以全序列及分段氨基酸的组成作为模型输入值.通过主成分分析(PCA)方法探讨全序列及分段氨基酸组成和最适pH值的相关性,运用均匀设计法分别优化支持向量机和BP神经网络运行参数.研究结果表明:支持向量机获得的预测模型优于神经网络,其中RBF支持向量机是最佳的模型.主成分分析结果显示:I端主成分跟最适pH值相关性最高;相关系数R绝对值为0.68,得到的结果与支持向量机结果一致.

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