|
OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用：99美元
|
|
|
|
全血改进线性指数聚合酶链式反应用于焦磷酸测序检测基因多态性
DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.140395, PP. 55-62
Keywords: 全血直接扩增,线性指数聚合酶链式反应,焦磷酸测序,基因多态性,酒精代谢
Abstract:
焦磷酸测序是目前基因多态性检测的主要方法之一,但是其前期的样本制备工作较为繁琐,限制了其在临床检测中的应用.为了简化焦磷酸测序的流程,本研究根据不对称PCR原理,改进了线性指数聚合酶链式反应(LATE-PCR)的引物设计方法,增加过量引物的长度和浓度,并结合全血直接扩增技术,建立了基于普通rTaq聚合酶和高pH缓冲液(HpHBuffer)的全血改进LATE-PCR(ImprovedLATE-PCR,imLATE-PCR)方法.考察了方法的最优扩增体系、血液抗凝剂对其影响以及全血模板量.采用单管、一步法直接扩增出单链测序模板,成功地对24例临床血样的乙醇脱氢酶基因多态性进行了检测,检测结果可用于指导临床个体化用药.24例样本的基因型分别为ADH1B位点AA纯合6例、AG杂合14例、GG纯合4例;ADH1C位点GG纯合20例、AG杂合4例、AA纯合0例.
| [1] | 陈之遥, 周国华. 现代生物医学进展, 2008, 8(8): 1573-1576
|
| [2] | 3 YE Hui, LIU Yun-Long, ZOU Bing-Jie, WU Hai-Ping, ZHOU Guo-Hua. Chinese J. Anal. Chem., 2013, 41(9): 744-748
|
| [3] | 叶 卉, 刘云龙, 邹秉杰, 武海萍, 周国华. 分析化学, 2013, 41(9): 744-748
|
| [4] | 6 Brakensiek K, Wingen L U, Langer F, Kreipe H, Lehmann U. Clin. Chem., 2007, 53(1): 17-23
|
| [5] | 9 Royo J L, Hidalgo M, Ruiz A. Nat. Protoc., 2007, 2(7): 1734-1739
|
| [6] | 11 Salk J J, Sanchez J A, Pierce K E, Rice J E, Soares K C, Wangh L J. Anal. Biochem., 2006, 353(1): 124-132
|
| [7] | 12 Liu Y L, Wu H P, Ye H, Chen Z Y, Song Q X, Zou B J, Rui G J, Zhou G H. Anal. Methods, 2014, 6(5): 1384-1390
|
| [8] | 15 Wu H P, Wu W J, Chen Z Y, Wang W P, Zhou G H, Kajiyama T, Kambara H. Anal. Chem., 2011, 83(9): 3600-3605
|
| [9] | 17 ZENG Fang-Fang, LIU Sheng-Yuan, WANG Bin-You. Chin. J. Dis. Control Prev., 2008, 12(2): 164-167
|
| [10] | 18 Yamauchi M, Maezawa Y, Mizuhara Y, Ohata M, Hirakawa J, Nakajima H, Toda G. Hepatology, 1995, 22(4): 1136-1142
|
| [11] | 1 Ronaghi M, Uhlen M, Nyren P. Science, 1998, 281(5375): 363-365
|
| [12] | 2 CHEN Zhi-Yao, ZHOU Guo-Hua. Progress in Modern Biomedicine, 2008, 8(8): 1573-1576
|
| [13] | 4 Chen Z Y, Fu X Y, Zhang X D, Liu X Q, Zou B J, Wu H P, Song Q X, Li J H, Kajiyama T, Kambara H, Zhou G H.Chem. Commun., 2012, 48(18): 2445-2447
|
| [14] | 5 Yang H Y, Huang H, Wu H P, Zou B J, Zhou G H, Kajiyama T, Kambara H. Anal. Methods, 2011, 3(11): 2517-2523
|
| [15] | 7 Schuster S C. Nat. Methods, 2008, 5(1): 16-18
|
| [16] | 8 Diggle M A, Clarke S C. Mol. Biotechnol., 2003, 24(2): 221-224
|
| [17] | 10 YANG Hui-Yong, XI Tao, LIANG Chao, CHEN Zhi-Yao, XU Ding-Bang, ZHOU Guo-Hua. Chinese J. Anal. Chem., 2009, 37(4): 489-494
|
| [18] | 杨会勇, 奚 涛, 梁 超, 陈之遥, 徐定邦, 周国华. 分析化学, 2009, 37(4): 489-494
|
| [19] | 13 Song Q X, Yang H Y, Zou B J, Kajiyama T, Kambara H, Zhou G H. Analyst, 2013, 38(17):4991-4997
|
| [20] | 14 LIU Yun-Long, CHEN Zhi-Yao, WU Hai-Ping, ZHOU Guo-Hua. Chinese J. Anal. Chem., 2012, 40(7): 1037-1042
|
| [21] | 刘云龙, 陈之遥, 武海萍, 周国华. 分析化学, 2012, 40(7): 1037-1042
|
| [22] | 16 Bu Y, Huang H, Zhou G H. Anal. Biochem., 2008, 375(2): 370-372
|
| [23] | 曾芳芳, 刘盛元, 王滨有. 疾病控制杂志, 2008, 12(2): 164-167
|
| [24] | 19 ZHANG Zhu-Mei, BIAN Jian-Chao. Chin. J. Med. Genet., 2001, 18(1): 62-65
|
| [25] | 张竹梅, 边建超. 中华医学遗传学杂志, 2001, 18(1): 62-65
|
| [26] | 20 Royo J L, Hidalgo M, Ruiz A. Nat. Protoc., 2007, 2(7): 1734-1739
|
| [27] | 21 Royo J L, Galan J J. Methods Mol. Biol., 2009, 578: 123-133
|
Full-Text
|
|
Contact Us
service@oalib.com QQ:3279437679 
WhatsApp +8615387084133
|
|
