基于SSR和ISSR的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析

用SSR(simplesequencerepeat)和ISSR(inter-simplesequencerepeat)标记对鄱阳湖流域30个野生菰居群的遗传多样性与遗传结构进行了分析。筛选出的19对SSR引物共扩增出多态性条带253条，平均多态性条带比率（PPB）为91.67%，Nei’s基因多样性指数（He）和平均Shannon信息指数（I）分别为0.2712和0.4144，遗传相似性系数（GS）为0.5590～0.8368，遗传距离（GD）的变化范围为0.1632-0.4410；筛选出的14个ISSR标记引物共扩增产生83条条带，平均多态性条带比率（PPB）为78.29%，Nei’s基因多样性指数（He）和平均Shannon信息指数（I）分别为0.2386和0.4174，遗传相似性系数（GS）为0.5132-0.9342，遗传距离（GD）变化范围为0.0658-0.4868。根据SSR和ISSR基因型数据，采用UPGMA法分别在阈值为0.698和0.728时可将30个野生菰居群聚类为3类。可能受人为、水流、动物活动、风等多种因素的影响，居群间的亲缘关系与地理分布无明显相关性。本研究表明，鄱阳湖流域野生菰居群间SSR和ISSR基因型的多样性丰富，居群间的这种遗传差异或变异，对该地区乃至更大范围内野生菰的遗传进化、基因资源的开发利用和种质资源的保护有着重要意义。