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园艺学报 2012
龙眼tir1和abp1基因的克隆及其在体胚发生过程中的表达分析, PP. 253-264 Keywords: 龙眼,胚性愈伤组织,生长素受体基因,生长素结合蛋白基因,克隆,序列分析,实时荧光定量pcr法 Abstract: 采用rt-pcr结合race法,分离克隆龙眼(dimocarpuslonganlour.)胚性愈伤组织生长素受体基因tir1(transportinhibitorresponse1,即dl-tir1)和生长素结合蛋白基因abp1(auxinbidingprotein1,即dl-abp1),运用生物信息学方法对序列进行分析,并通过实时荧光定量pcr法研究其在龙眼体细胞胚胎(以下简称龙眼体胚)发生过程中的表达。结果表明:dl-tir1为2328bp的mrna全长序列(genbank,gq870264),包含1个长为1761bp的开放阅读框,5′非编码区为118bp,3′非编码区为449bp,推定的氨基酸序列含586个氨基酸,与其它植物tir1具有85%~57%同源性;dl-tir1在龙眼体胚的各阶段均有表达,整个变化趋势呈近似“w”状,在子叶形胚中的表达量最高。dl-abp1为869bp的mrna全长序列(genbank,gq900592),包含1个长为567bp的开放阅读框,5′非编码区为43bp,3′非编码区为259bp;推定的氨基酸序列含188个氨基酸,与其它植物abp1具有87%~72%同源性,dl-abp1在龙眼体胚中整个表达变化趋势也呈现近似“w”状。生长素受体dl-tir1和“可能的”生长素受体dl-abp1在龙眼体胚中的变化趋势极为相似。
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