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ISSN: 2333-9721
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高温胁迫下水稻灌浆初期籽粒的全长cDNA文库构建及其分析

DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2015.08.1437, PP. 1437-1443

Keywords: 水稻,灌浆期,籽粒,高温胁迫,全长cDNA文库

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Abstract:

为克隆水稻灌浆期耐热性相关基因的全长cDNA序列,本研究以水稻灌浆期耐热纯系XN0437T和热敏感纯系XN0437S为材料,于灌浆初期(扬花后第8天)进行38.0/33.0±0.5℃(白天/夜间)温度处理,设3次高温处理重复;高温处理结束时,取耐热和热敏感纯系籽粒提取总RNA,3次高温处理样品的总RNA等量混合后,利用SMART技术合成cDNA双链,经琼脂糖凝胶电泳分离后,分5个区段回收大小不同的cDNA,分别克隆到pGEM-TEasyVector载体,构建了5个全长cDNA亚文库并分析了这些亚文库的质量。结果表明:5个全长cDNA亚文库共获得7974个阳性克隆,平均插入片段大于1.0kb,整个文库的全长率约为75%;插入片段大于0.5kb的亚克隆文库的滴度均大于4.6×106pfu·mL-1、重组率大于98.1%±0.79%。为获得全长cDNA文库克隆目的基因的全长奠定了基础。

References

[1]  滕中华, 智丽, 宗学凤, 王三根, 何光华. 高温胁迫对水稻灌浆结实期叶绿素荧光、抗活性氧活力和稻米品质的影响[J]. 作物学报, 2008, 34(9): 1662-1666
[2]  李健陵, 林育炯, 张晓艳, 杜尧东, 王华, 吴丽姬, 胡飞. 抽穗期和乳熟期高温对水稻剑叶理化特性以及产量和品质的影响[J]. 农业现代化研究, 2013, 34(1): 109-113
[3]  刘书通. 长江中下游地区水稻生产能力分析[D]. 北京:中国农业科学院, 2014
[4]  张倩, 赵艳霞, 王春乙. 长江中下游地区高温热害对水稻的影响[J]. 灾害学, 2011, 26(4): 57-62
[5]  谭江, 李小湘, 潘孝武, 黎用朝. 水稻灌浆期耐热性研究进展[J]. 杂交水稻, 2012, 27(5): 15-19
[6]  姜宝杰, 陈华, 张冲, 邓烨, 蔡铁成, 石新国, 庄伟建. 环境胁迫诱导的花生全长cDNA文库的构建及序列分析[J]. 核农学报, 2013, 27(5): 545-551
[7]  朱利军, 长孙东亭, 罗素兰. 全长cDNA文库构建方法及应用研究[J]. 海南大学学报:自然科学版, 2009, 27(2): 185-190
[8]  Carninci P, Shibata Y, Hayatsu N, Sugahara Y, Shibata K, Itoh M, Konno H, Okazaki Y, Muramatsu M, Hayashizaki Y. Normalization and subtraction of cap-trapper-selected cDNAs to prepare full-length cDNA libraries for rapid discovery of new genes[J]. Genome Research, 2000, 10(10): 1617-1630
[9]  郑玲, 张玉芹, 张传云, 刘国栋, 王芙蓉, 张军. 棉花GhBI-1基因全长cDNA的克隆与表达分析[J]. 核农学报, 2011, 25(1): 20-25
[10]  谢卡斌, 张建伟, 向勇, 冯旗, 韩斌, 储昭晖, 王石平, 张启发, 熊立仲. 10828条籼稻全长cDNA的分离和注释[J]. 中国科学C辑:生命科学, 2005, 35(1): 6-12
[11]  毛新国, 景蕊莲, 孔秀英, 赵光耀, 贾继增. 几种全长cDNA文库构建方法比较[J]. 遗传, 2006, 28(7): 865-873
[12]  陈华, 邓烨, 张冲, 蔡铁城, 熊发前, 唐荣华, 周双彪, 庄伟建. 花生茎全长cDNA文库的构建与分析[J]. 核农学报, 2014, 28(10): 1765-1772
[13]  Zhu Y Y, Machleder E M, Chenchik A, Li R, Siebert P D. Reverse transcriptase template switching: a SMART approach for full-length cDNA library construction[J]. Biotechniques, 2001, 30(4): 892-897
[14]  Edery I, Chu L L, Sonenberg N, Pelletier J. An efficient strategy to isolate full-length cDNAs based on an mRNA cap retention procedure (CAPture)[J]. Molecular and Cellular Biology, 1995, 15(6): 3363-3371
[15]  Suzuki Y, Sugano S. Construction of a full-length enriched and a 5'-end enriched cDNA library using the oligo-capping method[J]. Methods in Molecular Biology, 2003, 221: 73-91
[16]  Efimov V A, Chakhmakhcheva O G, Archdeacon J, Fernandez J M, Fedorkin O N, Dorokhov Y L, Atabekov J G. Detection of the 5'-cap structure of messenger RNAs with the use of the cap-jumping approach[J]. Nucleic Acids Research, 2001, 29(22): 4751-4759
[17]  Carninci P, Kvam C, Kitamura A, Ohsumi T, Okazaki Y, Itoh M, Kamiya M, Shibata K, Sasaki N, Izawa M, Muramatsu M, Hayashizaki Y, Schneider C. High-efficiency full-length cDNA cloning by biotinylated CAP trapper[J]. Genomics, 1996, 37(3): 327-336
[18]  Liao J L, Zhang H Y, Liu J B, Zhong P A, Huang Y J. Identification of candidate genes related to rice grain weight under high-temperature stress[J]. Plant Science, 2012, 196: 32-43
[19]  Liao J L, Zhou H W, Zhang H Y, Zhong P A, Huang Y J. Comparative proteomic analysis of differentially expressed proteins in the early milky stage of rice grains during high temperature stress[J]. Journal of Experimental Botany, 2014, 65(2): 655-671
[20]  Liao J L, Zhang H Y, Shao X L, Zhong P A, Huang Y J. Identification for heat tolerance in backcross recombinant lines and screening of backcross introgression lines with heat tolerance at milky stage in rice[J]. Rice Science, 2011, 18(4): 279-286
[21]  Sambrook J, Russell D W. 分子克隆实验指南 [M]. 第三版.黄培堂,译. 北京: 科学出版社, 2007: 901-917
[22]  谢胜松, 李新云, 苏立杰, 顾婷, 赵书红. 一种简易快速鉴定动物组织总RNA质量的方法[J]. 农业生物技术学报, 2009, 17(2): 282-287
[23]  陈华, 邓烨, 张冲, 蔡铁成, 郑奕雄, 庄伟建. 不同发育时期花生胚混合全长cDNA文库的构建与分析[J]. 中国农业科学, 2014, 47(11): 2272-2280
[24]  杨丽萍, 杨慧荣, 张勇, 刘云, 黄海, 刘晓春, 蒙子宁, 黄俊海, 林浩然. 中国大鲵脑cDNA文库构建及促甲状腺激素β亚基基因cDNA的克隆和序列分析[J]. 水产学报, 2008, 32(4): 507-516
[25]  郑善清, 段瑞军, 郭建春. 盐生植物海马齿盐胁迫全长cDNA文库的构建与分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2010, 29(1): 155-159
[26]  Jagadish S V, Craufurd P Q, Wheeler T R. High temperature stress and spikelet fertility in rice (Oryza sativa L.)[J]. Journal of Experimental Botany, 2007, 58(7): 1627-1635
[27]  Lin C J, Li C Y, Lin S K, Yang F H, Huang J J, Liu Y H, Lur H S. Influence of high temperature during grain filling on the accumulation of storage proteins and grain quality in rice (Oryza sativa L.)[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2010, 58(19): 10545-10552
[28]  Peng S, Huang J, Sheehy J E, Laza R C, Visperas R M, Zhong X, Centeno G S, Khush G S, Cassman K G. Rice yields decline with higher night temperature from global warming[J]. Proceedings of National Academy of Sciences of the United States of America, 2004, 101(27): 9971-9975

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