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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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Feature weight-based FCM clustering algorithm for gene expression data
一种适用于基因表达数据的特征加权FCM算法*

Keywords: gene expression data,pre-processing algorithm,inter-cluster entropy,weighted fuzzy clustering
基因表达数据
,预处理算法,类间熵,加权模糊聚类

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Abstract:

针对FCM算法应用于基因表达数据分析时存在的局限性,提出一种特征加权自适应FCM算法。该算法在FCM算法的基础上引入数据集预处理机制,可依据数据集的分布特征自适应地获取分类数目和初始聚类中心,并通过ReliefF算法实现特征权值的自动确定。同时,新算法考虑了不同属性对分类贡献的差异,在FCM算法中引入特征权重。将算法应用于真实基因表达数据集,实验结果表明,算法能够自适应地确定聚类数目、获得稳定性较好的聚类结果,而且具有较高的聚类精度。

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