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ISSN: 2333-9721
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海洋科学  2011 

TaqMan-MGB probe real-time fluorescence quantitative RT-PCR for rapid detection of taura syndrome virus in shrimps
TaqMan-MGB探针法快速检测对虾Taura合征病毒的研究

Keywords: TSV,TaqMan-MGB probe,one step real-time RT-PCR
TSV
,Taqman-MGB探针,一步法荧光定量,RT-PCR

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Abstract:

为建立Taura综合征病毒(Taura syndrome virus,简称TSV)的TaqMan—MGB探针荧光定量RT-PC方法,根据TSV衣壳蛋白基因保守序列设计引物和TaqMan—MGB探针,扩增产物长度为118bp。将PCR产物克隆到pGM—T载体,重组质粒经筛选鉴定、SalⅠ单酶切,得到线性化转录模板DNA,经体外转录获得标准品RNA。以体外转录的RNA作为模板,进行一步法荧光定量RT-PCR反应,根据RNA模板拷贝数与Ct(Cycle threshold,Ct)值制备了标准曲线,制作的标准曲线在2×10^1拷贝/μL≤TSV RNA≤2×10^7拷贝/此的范围内具良好的线性关系,可以用于TSV的定量分析,检测灵敏度为20个拷贝数。特异性、重复性试验结果表明,该方法对SPF对虾组织RNA没有扩增反应,表现出良好的特异性;组内和组间实验变异系数分别为0.32%~1.84%和0.79%-2.71%。利用TaqMan—MGB探针建立检测TSV的一步法荧光定量RT-PCR方法可用于对虾TSV的检测。

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