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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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Real-time quantitative RT-PCR assay for detection of IHNV in fish
实时定量RT-PCR检测鱼类传染性造血器官坏死病毒方法的建立与应用

Keywords: IHNV,Real-time quantitative RT-PCR,Taqman probe
传染性造血器官坏死病毒(IHNV)
,实时定量RT-PCR,Taqman探针,实时定量,快速检测,鱼类,传染性,造血器官,坏死,病毒,方法,建立与应用,FISH,DETECTION,ASSAY,意义,鱼病,灵敏度,定量分析,感染,样品,扩增反应,核酸

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Abstract:

建立了Taqman 实时定量RT-PCR方法检测传染性造血器官坏死病毒(IHNV).选取IHNV病毒的N蛋白基因保守序列,利用Primer Express 2.0软件设计引物和探针.以梯度稀释的含有IHNV目的扩增片段的质粒作为标准品,进行定量RT-PCR反应以确定检测灵敏度.病毒浓度在5×106 -5个拷贝,共7个数量级的范围内,定量RT-PCR反应有"S"型扩增曲线,检测灵敏度为5个拷贝.根据病毒拷贝数与定量反应Ct值的关系,绘制了标准曲线.该方法具有特异性,对鲤春血症病毒(SVCV)、病毒性出血性败血症(VHSV)、传染性胰脏坏死病毒(IPNV)、草鱼呼肠孤病毒(GCRV)、流行性造血器官坏死病毒(EHNV)、EPC细胞系、牙鲆的核酸都没有扩增反应.在50批待检样品中,有3批鱼类感染IHNV,利用标准曲线进行了定量分析.实时定量RT-PCR检测IHNV方法,灵敏度高,特异性好,可以进行定量分析,在鱼病的快速检测上具有重要意义.

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