The prediction of amine receptors ligand-binding region and sites
生物胺受体配基结合区域及其位点的预测

生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标，用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能，对于药物设计具有重要的指导意义。从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型，预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ，其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用，E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程，这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸。从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif，提出了父家族可变子家族保守motif概念，即父家族可变区中出现的子家族保守的motif最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能，预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点，结果证明与突变实验结果有很好的吻合度。