%0 Journal Article
%T The prediction of amine receptors ligand-binding region and sites
生物胺受体配基结合区域及其位点的预测
%A GUO Zhi-yun
%A ZHANG Huai-yu
%A WANG Yue-lan
%A YUE Jun-jie
%A LIANG Long
%A HUANG Pei-tang
%A
郭志云
%A 张怀渝
%A 王月兰
%A 岳俊杰
%A 梁龙
%A 黄培堂
%J 生物物理学报
%D 2005
%I
%X 生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标,用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能,对于药物设计具有重要的指导意义。从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型,预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ,其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用,E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程,这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸。从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif,提出了父家族可变子家族保守motif概念,即父家族可变区中出现的子家族保守的motif最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能,预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点,结果证明与突变实验结果有很好的吻合度。
%K Amine receptor
%K Ligand
%K Motif
%K Function
%K Bioinformatics
生物胺受体
%K 配基
%K motie生物信息学
%K 功能
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=E0C9D9BBED813D6674AC13E942EAC86D&aid=A36145AD79255388&yid=2DD7160C83D0ACED&vid=659D3B06EBF534A7&iid=0B39A22176CE99FB&sid=C36EC077A8A90308&eid=331211A5F5616413&journal_id=1000-6737&journal_name=生物物理学报&referenced_num=0&reference_num=12