贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析

目的 分析贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点的分布特点、鉴别能力和应用价值, 为中药材贝母精准鉴定方法的建立提供技术支撑。方法 应用多重序列比对、SNP筛选、酶切位点分析等生物信息学分析手段, 对贝母属6种药用植物的15条叶绿体基因组序列进行分析。结果 贝母属叶绿体基因组DNA同源性达98.38%, 通过分析共发现SNP位点4058个, 其中川贝母类鉴别候选位点71个, 瓦布贝母鉴别候选位点个25个, 太白贝母鉴别候选位点个120个, 浙贝母鉴别候选位点个79个, 湖北贝母鉴别候选位点个61个, 平贝母鉴别候选位点794个。结论 叶绿体基因组SNP分子标记因其密度高、鉴别力强和便于分析的特点, 具有较大的应用价值