盾叶薯蓣WRKY转录因子的鉴定和生物信息学分析

目的 鉴定盾叶薯蓣WRKY（DzWRKY）转录因子家族基因，分析DzWRKY蛋白的序列特征，检测DzWRKY在根和叶中的表达量。方法 以拟南芥WRKY基因的cDNA为查询序列，应用BLASTn进行比对，应用生物信息学方法进行全长开放阅读框（ORF）预测和蛋白序列特征分析，根据转录组数据检测DzWRKY的表达量。结果 共检测到27个具有全长ORF的DzWRKY家族基因，其中6个基因编码的蛋白具有2个WRKY结构域。DzWRKY蛋白均为亲水性蛋白，亚细胞预测为核蛋白，WRKY结构域序列保守程度高。进化分析均把27个DzWRKY蛋白和19个AtWRKY蛋白分为3个大类群。27个DzWRKY在叶片中的表达量均比根茎低，高表达的DzWRKY基因主要集中在第I类和第IId亚类。盾叶薯蓣WRKY与已知功能的WRKY序列相似性较低。结论 首次从盾叶薯蓣中鉴定出DzWRKY基因，为进一步阐明DzWRKY在盾叶薯蓣生长发育和药效成分代谢中的作用奠定基础