不同地理居群破布叶的psbA-trnH和ITS2序列及其聚类分析

目的 探讨破布叶Microcos paniculata不同地理居群间的DNA序列变异与地理分布的关系，为其种质资源评价和基原植物的分子鉴定提供参考。方法 对破布叶14个居群14份个体样品以改良的3×CTAB法提取基因组DNA，选择特异的引物扩增ITS2和psbA-trnH序列；PCR扩增产物直接双向测序分析。DNAMAN 8.0软件处理测序数据，MEGA6.0软件计算K2P遗传距离，运用NJ法构建系统聚类树。结果 破布叶14个居群的ITS2序列均为462 bp，共检测到14个变异位点，居群间遗传距离0.000 0~0.019 8。除云南景洪居群样本的psbA-trnH序列存在8 bp缺失外，其他13个居群样本的psbA-trnH序列均长387 bp，无变异，居群间遗传距离为0.000 0。结论 不同地理居群破布叶的psbA-trnH较ITS2更为保守，二者PCR扩增引物特异性好，扩增效率和测序成功率高，对其药材及基原植物的分子鉴定可采用psbA-trnH为主，ITS2序列为辅的DNA条形码技术