甘草中新NADPH细胞色素P450还原酶基因的克隆与相关生物信息学分析

目的 从甘草Glycyrrhiza uralensis中克隆1个新的NADPH细胞色素P450还原酶基因（GuCPR，登录号：MH401048）并进行生物信息学分析。方法 提取甘草根部总RNA后逆转录为cDNA，通过转录组数据库筛选得到GuCPR基因全长，利用NCBI ORF finder得到其开放阅读框并翻译得氨基酸序列，设计引物进行PCR扩增，构建克隆重组质粒。利用生物信息分析预测蛋白性质、结构等及模拟蛋白三级结构，并构建同源系统进化树。结果 克隆得到GuCPR基因cDNA全长2 118 bp，编码705个氨基酸残基，相对分子质量78 450，等电点（pI）5.19。GuCPR蛋白为非分泌蛋白，不具有信号识别功能。跨膜预测结果显示蛋白的第44~64位氨基酸为跨膜区，同时，亚细胞定位预测结果显示蛋白位于内质网上。结论 克隆得到一个新的GuCPR，并进行了生物信息学分析，为进一步研究提供了理论基础