草珊瑚叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析

目的 构建草珊瑚Sarcandra glabra叶片全长cDNA文库，进一步发掘与草珊瑚代谢及抗逆相关的基因，为草珊瑚功能基因的发现提供实验基础。方法 以草珊瑚的嫩叶为实验材料，利用SMART法（即Clontech公司SMARTer试剂盒）构建草珊瑚全长cDNA文库。利用ABI3730 DNA序列分析测序获得大量的EST序列，利用生物信息分析方法对EST序列进行功能注释。结果 构建了草珊瑚叶片的全长cDNA文库，经过鉴定草珊瑚cDNA文库的文库滴度为1.14×107 cfu/mL，平均插入片段为1 000 bp。利用该文库测序了221个单克隆，共获得EST序列177条，拼接出151个单一序列；利用NCBI数据库进行同源比对分析，共有119条（79%）与已知基因有显著的同源性，进行GO功能注释，显示其表达术语涉及了细胞生长，信号转导，蛋白质合成、转录，抗逆反应以及能量代谢等。结论 构建了符合要求的草珊瑚叶片全长cDNA文库，并对相关EST序列进行了生物信息学分析，为草珊瑚基因组学研究提供一定的参考