山茱萸转录因子CobHLH7基因的克隆及分析

目的 克隆山茱萸转录因子CobHLH7的cDNA序列。方法 以转录组数据中unigene c15204_g1序列为参考，在其开放阅读框两端设计特异引物，提取山茱萸果实总RNA，并反转录成cDNA，以此为模板，经RT-PCR扩增、连接pMD19-T克隆载体并测序，获得CobHLH7的cDNA序列。通过Protparatam、ProtScale、SOPMA等软件，对其进行生物信息学分析。结果 CobHLH7的cDNA长度为941 bp，编码266个氨基酸，其相对分子质量为29 220，等电点为6.32。经SOPMA在线软件预测，该蛋白为不稳定蛋白，其高级结构以α-螺旋和无规卷曲为主，含有少量的β-转角和延伸带。多序列比对和亲缘关系比较显示，CobHLH7氨基酸序列与马铃薯和模式植物烟草的bHLH类转录因子亚家族的ILR3同源性较高。结论 在首次对山茱萸叶片和果实转录组测序的基础上，对筛选并预测的可能与环烯醚萜苷合成相关的转录因子CobHLH7进行克隆与生物信息学分析，为进一步研究其功能奠定基础