刺五加转录组和差异性表达分析

目的 获得刺五加Eleutherococcus senticosus转录组数据库和差异表达基因。方法 采用皂苷高含量组和低含量组2个样本作为受试材料，采用二代测序方法中的Illumina HiSeq 4000进行转录组测序，并进行系统的生物信息学分析。结果 共获得8.34 Gb数据，拼接得到77 087条Unigenes，与5个基因数据库进行比对，可归类于55个Geneontology（GO）分类中，涉及到116个KEGG标准代谢通路。通过差异性分析发现，差异性表达基因共530条，其中上调基因占42.08%，下调基因占57.92%，相差较大。进行GO和Pathway富集，得到408个GO注释和40个代谢通路。结论 对刺五加转录组进行拼接、组装和功能注释，得到大量转录本信息，为刺五加分子生物学研究提供了宝贵的基因组数据库资源