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ISSN: 2333-9721
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-  2016 

白桦BpHMGR基因的结构及表达模式分析

DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.06.021

Keywords: 白桦 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 还原酶 生物节律 一氧化氮 生物信息学分析

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Abstract:

目的 研究白桦Betula platyphylla 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 还原酶(3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase,BpHMGR)全长基因结构特征及编码蛋白性质,揭示其节律表达模式以及对外源NO 信号分子的响应机制。方法 通过RACE技术克隆白桦BpHMGR 基因,应用生物信息学软件对BpHMGR 及其编码蛋白进行详细分析,利用实时荧光定量PCR 定量分析BpHMGR 基因在昼夜节律变化中的表达模式。根据BpHMGR 氨基酸序列构建系统进化树,分析昼夜节律以及外源NO对白桦叶片中BpHMGR 转录水平的影响。结果 BpHMGR 基因全长1 764 bp,包含完整开放阅读框,已上传至NCBI,并获得登录号KJ452334,其编码蛋白由587 aa 组成。白桦BpHMGR 基因与大豆(XP_003519474.1)、葡萄(XP_002275827.1)、苜蓿(XP_003617066.1)亲缘关系较近。结论 BpHMGR 随昼夜周期变化呈现出节律表达特性,在夜晚21:00 时达到峰值。初步揭示了外源NO 能诱导白桦细胞内三萜代谢途径的关键酶BpHMGR 基因上调表达,进而促进三萜产物齐墩果酸的合成

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