降解组测序技术对人参miRNA靶基因的分析鉴定

目的 分析鉴定人参miRNA靶基因。方法 采用降解组测序技术对石柱参（Shizhu ginseng）、园参（Yuan ginseng）的miRNA及靶基因进行检测；利用公共数据库KEGG/NR/GO数据库对降解组基因进行功能注释；通过荧光实时定量PCR（qRT-PCR）技术验证石柱参、园参的miRNA及靶基因表达量。结果 共得到8个miRNA家族的13个靶基因；利用KEGG/NR/GO数据库分析发现该miRNA的靶基因类型主要是转录因子、应答因子及信号转导通路等。对5个差异表达miRNAs：aqc-miR-159、bdi-miR162、cpa-miR319、pgi-miR4376、smo-miR396及其靶基因进行的qRT-PCR验证结果与降解组测序结果一致。结论 明确了部分人参miRNA的靶基因，为进一步研究人参miRNA的可能功能奠定基础