轮叶党参EST-SSR标记的开发及在党参属中的应用

目的 开发EST-SSR标记，分析其在党参属及近缘属种间的通用性。方法 利用MISA软件对轮叶党参在NCBI公布的EST序列进行SSR位点查找，Primer 3.0软件设计引物，经PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对引物进行初步筛选，聚丙烯酰胺凝胶电泳对所筛选的引物进行多态性检测。结果 共查找到204个EST-SSR位点，总长5 263 bp，平均长度25.80 bp，出现频率为22.97%，其中单核苷酸、二核苷酸和六核苷酸重复占比最多，分别为36.8%、24.8%和15.3%。单核苷酸、二核苷酸、六核苷酸中的主要重复基元类型是A、TG和CAGCTC/GTGGCA。共设计引物112对，以党参为模板，能够扩增出清晰稳定条带的引物有67对，有效引物比率59.82%，其中27对能扩增出多态性条带，多态引物比率24.11%。随机选取5对引物对党参属及桔梗共12份材料进行PCR扩增，聚类结果将党参属和桔梗属分为2大类。结论 研究筛选出的EST-SSR标记能够在党参属及近缘属内进行区分鉴别，研究结果为党参种质鉴别、遗传多样性分析及资源的评价利用等提供了重要技术手段