基于ITS2序列的滨海白首乌及其近缘种DNA分子鉴定

目的 采用ITS2条形码鉴定滨海白首乌及其近缘种药用植物。方法 采集滨海白首乌Cynanchum auriculatum及其近缘种植物样品共54份，分别提取基因组DNA，通过PCR扩增ITS2序列并进行双向测序，测序结果提交至GenBank；从GenBank下载萝？科植物16种47条序列，并通过ITS2数据库注释出ITS2序列；对提交与下载的101条序列，应用MEGA 5.0软件进行序列比对，计算种内和种间距离，采用相似性搜索法、最近距离法进行鉴定分析，并构建neighber-joining（NJ）系统进化树直观反映鉴定结果。结果 滨海白首乌ITS2序列长度均为249 bp，是1个单倍型，与萝？科鹅绒藤属植物距离较近，与萝？科其他属近缘种之间遗传距离较远，NJ树结果显示滨海白首乌及其近缘种药用植物均可明显区分，表现出良好的单系性，依据ITS2二级结构，也可以直观地将滨海白首乌与萝？科近缘种区分。结论 ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别滨海白首乌，为保障安全用药提供了新的技术手段