细辛属8种药用植物rDNA ITS的克隆与序列分析

目的 克隆和分析8种细辛属药用植物的ITS序列，为开展该属植物分子鉴定和遗传多样性研究奠定基础。方法 以基因组DNA为模板，利用PCR法克隆ITS全长序列，借助生物信息学软件对序列进行比对分析，并构建系统发育树。结果 测序结果表明，8种细辛属植物的ITS全长为637～646 bp，其中的5.8 S序列最为保守，长度和碱基组成完全一致；ITS1与ITS2均存在一定的变异，它们的长度分别为255～257 bp和226～232 bp，序列中出现大量插入/缺失和转换/颠换现象，ITS1、ITS2的可变位点和简约信息位点数分别为46/30和14/9。系统发育分析结果表明，8种细辛属植物在进化树上可分为4组，与传统分类结果完全一致，I～IV分别对应细辛组、华细辛组、长花组和杜衡组。结论 8种细辛属植物ITS序列具有丰富的信息位点，可用于这些植物的分子鉴定