基于红花不同组织转录组数据的转录因子分析

目的 注释并分类红花Carthamus tinctorius中转录因子家族，分析其在不同组织间的表达水平差异。方法 使用红花不同组织转录组测序数据组装Unigene，利用Nr数据库中转录因子信息比对并注释红花转录因子，同时对MYB转录因子家族的基因表达、蛋白保守结构域及系统发育树等内容重点分析。结果 红花转录组测序数据中共获得731个转录因子，分属42个转录因子家族。MYB转录因子家族成员的表达及蛋白结构分析显示，MYB转录因子家族在花冠中表达差异显著，氨基酸序列中存在3个保守的蛋白核心结构，系统发育树分析显示聚为2类MYB亚族。结论 红花MADs-box、bHLH、MYB、AP2转录因子家族成员最多，在不同组织间表达差异显著，MYB转录因子家族具有一定保守性