西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析

对30个西瓜枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp. niveum菌株基因组DNA进行相关序列扩增多态性 (SRAP)分子标记分析, 以探究其遗传多样性与地理来源的关系。采用尖孢镰刀菌西瓜专化型Fusarium oxysporum f.sp. niveum 0、1、2号生理小种的基因组DNA为模板, 对225对SRAP引物进行筛选, 筛选出20对多态性、重复性较好且条带清晰的引物, 对30个菌株进行PCR扩增, 共扩增出386条带, 其中多态性条带有371条, 多态性比率为96.11%, 平均每对引物扩增出19.3个位点和18.55个多态性位点。UPGMA法聚类分析结果显示, 供试菌株两两之间的遗传相似系数范围为0.69~0.90, 平均为0.79, 说明尖孢镰刀菌西瓜专化型的遗传多样性较为丰富。基于SRAP标记聚类分析表明, 30个菌株在遗传相似系数为0.70处被划分为3个类群, I类群包含24个菌株, 其中18个来自湖南省, Ⅱ类群只包含1个来自黑龙江省哈尔滨市的菌株, 它和另一个来自黑龙江地区的菌株被划分到不同的类群, 且遗传距离相对较远; Ⅲ类群包含了5个菌株, 其中3个来自海南三亚, 其余两个来自湖南省。根据菌株的分布情况来看, 菌株的聚集与地理来源没有明显的相关性