海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体遗传结构分析

暹罗刺盘孢菌Colletotrichum siamense是引起海南橡胶树炭疽病的重要病原之一, 为了明确海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体的遗传结构, 本研究对海南5个市(县)的橡胶树暹罗刺盘孢菌的ITS序列进行分析。结果表明, 58个病菌样品可推导出11种单倍型, 其中单倍型H11包含样品数最多且在5个市(县)均有分布, 其次为单倍型H4, 在4个市(县)有分布。遗传分化指数(Fst)表明保亭种群与其他种群的遗传分化较大。AMOVA 分析显示, 遗传变异主要发生在种群内, 占总变异的93.9%。对所有地理种群病原菌 ITS 序列的核苷酸不配对进行分析, 表明病菌未经历过大规模的种群扩张。系统发育分析表明, 来自相同地区的病菌单倍型并没有聚在一起。研究结果表明海南橡胶树暹罗刺盘孢菌种群具有丰富的遗传多样性