基于转录组分析的染色体大片段缺失及其对井冈霉素高产菌株的影响

[目的]测试大片段删减低转录区域对菌体生长和井冈霉素产量的影响。[方法]通过转录组分析，选择染色体上连续的基因低转录区域进行大片段缺失，通过Cre-loxP位点特异性重组得到1.2 Mb片段缺失突变株LCY-4。HPLC检测缺失株井冈霉素产量的变化，并测定干重绘制生长曲线。[结果]通过转录组分析，我们在井冈霉素高产菌株TL01染色体左侧末端发现了1.9 Mb的连续基因低转录区，使用Cre-loxP系统对其中的1.2 Mb区域进行大片段缺失，成功得到了1.2 Mb缺失突变株LCY-4。和出发菌株TL01相比，缺失突变株LCY-4中井冈霉素发酵产量基本保持不变，生物量有显著提高，最高增幅达到44%。[结论]1.2 Mb区域的成功缺失，意味着基于转录组分析寻找连续的基因低转录区域并加以缺失的策略的可行性。1.2 Mb片段缺失对菌体生物量积累具有明显促进作用，为后续将其开发成氨基环醇类药物异源表达的通用高产宿主奠定了基础