来自安徽不同地区黄瓜绿斑驳花叶病毒（CGMMV）cp 基因的分子进化分析

为了揭示黄瓜绿斑驳花叶病毒（Cucumber green mottle mosaic virus , CGMMV）安徽分离物分子变异及系统进化情况，从安徽省5个地区采集感染CGMMV的葫芦科样本。提取感病样本总RNA，经RT-PCR扩增、克隆和测序，获得17个CGMMV分离物的cp基因序列。序列比对发现，17个CGMMV安徽分离物的cp基因核苷酸序列相似性极高，达98.4%~100%，与中国及东亚国家和地区的各个CGMMV分离物cp基因核苷酸序列相似性也非常高，达98.6%~100%，而与CGMMV西班牙分离物和俄罗斯分离物cp基因核苷酸序列相似性相对较低，为90.7%~92.6%。从构建的系统关系树可以看出，17个CGMMV安徽分离物与中国及东亚国家和地区的各个CGMMV分离物形成1个单独的分支，而CGMMV俄罗斯与西班牙分离物聚成另1个分支，说明来源于中国和东亚的CGMMV亲缘关系较近