基于线粒体控制区（D-loop）序列的珠江赤眼鳟遗传多样性与遗传分化

为了解珠江流域重要野生经济鱼类赤眼鳟的遗传多样性和遗传分化现状，对柳江、西江、北江、郁江、南盘江和红水河6个自然种群共170尾个体的线粒体控制区（D-loop）序列进行测定与分析. 结果显示，共获得长978 bp的序列，检测出106个单倍型，单倍型多样性平均为0.982 0，核苷酸多样性平均为0.013 53，表明珠江流域赤眼鳟具有较高的遗传多样性. 遗传距离和遗传分化结果均显示珠江流域赤眼鳟未出现明显分化，各种群亲缘关系较近. 基于D-loop序列构建的NJ树显示，106个单倍型分为两大支系（A支和B支）. A支包含6个种群中的大部分单倍型，未形成明显单系群；B支由西江种群的两个特有单倍型组成. 单倍型网络亲缘关系分析结果也表明其未出现明显分化. AMOVA分析结果表明，绝大部分变异出现在种群内（99.36%），而地理区间和地理区内种群间的变异很小. 中性检验显示，珠江流域赤眼鳟历史上曾发生过种群扩张. 综合上述研究结果，认为西江为珠江流域赤眼鳟的扩散中心. （图3 表5 参38