高通量测序研究松茸菌柄土壤细菌群落结构

为了解松茸-菌柄根际微生物互作关系，采用Illumina Hiseq 2500 平台高通量测序方法，研究松茸菌柄附着土壤的细菌群落结构，分析微生物因素对松茸的形成和生长的影响. 通过高通量测序共获得了6 730条质控序列，这些序列按照97%的相似度被分为928个操作分类单元（Operational taxonomic units，OTUs），这些OTUs又被分为22个细菌门、2个古细菌门、62个细菌纲、4个古细菌纲、90个细菌目、6个古细菌目、162个细菌科、7个古细菌科、275个细菌属、8个古细菌属. 在门的水平，变形菌门（Proteobacteria）在所有样品中均占主导，且在松茸菌柄土壤样品中高于对照样品；从纲的水平来看，β-变形菌门（Beta-proteobacteria）占主导，且在松茸菌柄土壤样品中高于对照样品；从属的水平看，伯克氏菌属（Burkholderia）隶属于变形菌门，在松茸土壤样品中的丰度显著高于对照，表明变形菌门对松茸的生长可能具有积极贡献，尤其是伯克氏菌属. 此外，一些菌可能对松茸的生长具有消极贡献，如Unknown-Ellin 60等. 本研究表明，细菌可能参与了松茸的生长和子实体的形成，但与细菌的丰富度不成正相关，这对松茸的人工种植将具有重要理论指导意义. （图5 表3 参34