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ISSN: 2333-9721
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SELEX法筛选宫颈癌前病变核酸适配子

DOI: 10.13345/j.cjb.170405

Keywords: 宫颈癌前病变,指数式富集的配体系统进化技术,生物标志物,PCR条件优化

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Abstract:

构建随机ssDNA文库,通过SELEX技术,以正常、炎性宫颈脱落细胞为反筛细胞,以上皮内低级别病变 (CIN1)、上皮内高级别病变 (CIN2、CIN3) 和鳞状细胞癌脱落细胞为正筛细胞,经过12轮筛选特异性适配子高度富集得到宫颈癌前病变适配子库,经特异性、亲和力分析和细胞免疫荧光确立高特异性适配子CIN-Ap4可作为诊断宫颈癌前病变生物标志物,为宫颈癌前病变分子诊断奠定理论基础,提供新思路。利用Prime Premier 5.0设计构建了随机ssDNA文库并根据文库两端固定序列设计引物,对对称PCR和间接不对称PCR中的退火温度、循环数以及上、下游引物浓度比等条件进行优化,分析确定50 μL反应体系中对称PCR的最佳反应条件为:最佳退火温度为49.5 ℃,最佳循环数为15个循环;间接不对称PCR的最佳反应条件为:50 μL反应体系中上、下游引物浓度的最佳比例为 80∶1,最佳循环数为35个循环。实验结果表明成功构建了寡核苷酸文库,在最适PCR条件下可获得理想的dsDNA和ssDNA,并具有良好的重复性,为顺利筛选适配子提供保证

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