猪7种腹泻相关病毒的临床检测及猪嵴病毒的遗传进化分析

为了解引起猪腹泻疫病的病毒性病原种类及感染现状，本研究首先针对7种报道较少但可引起猪腹泻的病毒性病原建立了多重RT-PCR检测方法，包括猪捷申病毒 (PTV)、猪萨佩罗病毒 (PSV)、猪丁型冠状病毒 (PDCoV)、猪嵴病毒 (PKV)、猪札幌病毒 (PSaV)、猪星状病毒 (PAstV)和猪环曲病毒 (PToV)。利用该方法对419份临床腹泻粪便样品进行筛检，结果显示PKV检出率最高，阳性率达26.98%–45.79%；PKV和其他病原混合感染率达9.52%–18.54%。基于PKV的高检出率及其在腹泻病中扮演重要角色，本试验进一步选取3个PKV阳性样品进行全基因组序列测定及遗传进化分析。测序结果表明，这3个阳性样品感染的PKV均归属于猪嵴病毒属，且与其他动物嵴病毒遗传距离较远，分别标记为CM-PKV、JS-PKV和PD-PKV；它们的全基因组同源性为88.1%–89.1%；CM-PKV与2013年报道的中国株JS-02a-CHN/2013同源性最高，而JS-PKV和PD-PKV则与2008年报道的匈牙利株K-30-HUN/2008/HUN同源性最高。这说明上海不同地区猪群中存在的PKV有明显的遗传差异，这种差异与病毒致病力的关系还有待深入研究。本研究为深入了解PKV的流行情况及探讨其在猪腹泻疫情中的作用提供了参考