计算机辅助CRISPR向导RNA设计

基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑已被成功应用于多种细胞类型中。计算机辅助的向导RNA (Guide RNA) 设计是使用CRISPR系统成功进行基因编辑的关键步骤之一。目前的计算工作主要致力于利用计算模型来提高sgRNA的打靶效率并降低其脱靶。文中对于目前存在的sgRNA设计工具进行综述，并且说明可以通过建立高效的计算模型，对当前的异质基因编辑数据进行整合挖掘，以获得无偏差的sgRNA设计规则，并预测影响sgRNA设计的关键特征。笔者认为，对于sgRNA打靶和脱靶效果的系统总结和评价，将有助于使用CRISPR系统进行更加精准的基因编辑和基因治疗