前列腺癌易感位点rs2252004的eQTL和meQTL研究

目的：全基因组关联性研究（GWAS）发现rs2252004与前列腺癌的易感性相关，本研究拟进一步探讨rs2252004参与前列腺癌发生的可能分子生物学机制。方法：运用TCGA公共数据库中的基因型、甲基化、基因表达数据，采用线性回归分析rs2252004基因型与其上下游1 Mb区域CpG位点的甲基化水平及相关基因表达的关联性。结果：rs2252004与FGFR2基因上的3个CpG位点的甲基化水平显著相关（cg25294906，P=0.031；cg03552039，P=0.042；cg16499947，P=0.049）。而FGFR2在50例配对的前列腺癌组织和癌旁组织中表达差异有统计学意义（P=9.3×10-11）。与GG基因型相比，rs2252004 GT基因型的前列腺癌患者的FGFR2基因表达量显著降低（P=0.007）。此外，GT/TT基因型与GG基因型患者的FGFR2表达量差异有统计学意义（P=0.006）。结论：rs2252004可能通过影响FGFR2甲基化水平，进而调控FGFR2基因的表达，从而参与前列腺癌的发生。