基于16S rDNA可变区测序技术对抗生素治疗后的6月龄内肺炎婴儿的呼吸道菌群现况调查

摘要 目的：观察＜6月龄肺炎婴儿的上、下呼吸道菌群状况。 方法：纳入2017年1至8月在复旦大学附属儿科医院呼吸科住院的＜6月龄的肺炎婴儿，同时收集口咽拭子及支气管肺泡灌洗液（BALF）标本，利用16S rDNA可变区测序技术分析呼吸道菌群结构，比较上、下呼吸道菌群。 结果：24例婴儿的口咽拭子和BALF标本进入本文分析。上呼吸道菌群丰度前5位依次是：链球菌属、假单胞菌属、普氏菌属7、韦荣球菌属和埃希氏志贺菌属，下呼吸道菌群丰度前5位依次是假单胞菌属、链球菌属、普氏菌属7、克雷伯菌属、罗氏菌属。下呼吸道菌群相较于上呼吸道有更多的独有菌，下呼吸道菌群的物种丰富度显著高于上呼吸道，多样性低于上呼吸道（P＜0.05）。上呼吸道与下呼吸道菌群丰度在前42位的菌属均为共有菌，占上、下呼吸道总细菌的98%以上。链球菌属和假单胞菌属是上、下呼吸道中相对丰度有显著差异的主要菌属。 结论：小婴儿肺炎的上、下呼吸道菌群均存在显著改变；上、下呼吸道菌群物种组成相似，物种比例有差异。