利用GBS技术开发烟草SNP标记及遗传多样性分析

摘要： 研究烟草种质资源的遗传背景，为烟草种质资源的高效利用提供依据。采用GBS （genotyping-by-sequencing）技术，挖掘92份烟草种质资源的SNP位点，并进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明，测序共获得了147.165 Gb数据，平均每个样本1.599 Gb，筛选后共获得93 685个高质量的SNP位点；不同地理来源烟草群体等位基因数（Na）为1.27~1.93，观测杂合度（Ho）变化范围为0.22~0.76，期望杂合度（He）为0.32~0.59，多态性位点数（PLN）范围为15 877~44 249，多态性位点比率（PPL）为26.61%~74.17%，遗传多样性指数（H）为0.19~0.52，遗传距离（GD）为-0.0148~0.3849。基于遗传距离的NJ聚类将材料划分为两个类群；群体遗传结构分析表明，本研究所用材料基于模型可划分为4个亚群。通过GBS技术得到的测序数据量较大且质量较高，群体多态性较高，整体遗传多样性偏低，群体结构划分与种质来源不完全相关