荷包猪SLA-DRB基因cDNA的克隆及分子进化特征分析

摘要 旨在研究荷包猪SLA-DRB基因的分子特征，设计引物用RT-PCR扩增3头荷包猪DRB基因cDNA，并克隆至pMD18-T Vector，阳性克隆测序并做序列分析，分别进行同源性、分子进化及主要氨基酸变异位点分析。结果表明，成功从3头荷包猪中扩增得到SLA-DRB基因，分别命名为SLA-DRB-HB01-03，经序列测定后，证实cDNA全长为836 bp，其中1-801为ORF区，共编码266个氨基酸。同源性分析显示，SLA-DRB-HB与其他SLA-DRB等位基因的同源性介于90.3%-99.8%之间。分子进化分析表明，荷包猪SLA-DRB-HB独立分支，与其他等位基因相比较，进化更加原始。氨基酸变异位点和多态性分析结果显示，SLA-DRB-HB本身存在一定的多态性