苋菜IRT1基因克隆、序列及表达分析

摘要 通过对镉超积累苋菜品种天星米铁转运蛋白基因(IRT1)的克隆、序列及表达分析,旨在为植物修复镉污染土壤奠定基础。依据同源克隆原理,通过RACE技术克隆苋菜IRT1基因及生物信息学方法分析基因序列结构和功能,Northern杂交研究基因表达。苋菜IRT1基因cDNA全长1 135 bp,包含完整的阅读框,编码322个氨基酸。苋菜IRT1蛋白与已知铁转运蛋白相似性在53.70%-63.04%,具有铁转运蛋白典型的功能结构特征,即N端含有1个信号肽、氨基酸序列上具有完整的ZIP家族功能结构域(Pfam:Zip)和7个跨膜结构域(TMs)。苋菜IRT1蛋白还具有1个COGO428超级家族(转运二价金属离子功能)、2个蛋白激酶C磷酸化位点和2个酪蛋白II磷酸化位点。低铁胁迫时苋菜根中IRT1基因表达量增加,加镉处理没有改变IRT1基因表达量。因此,推断苋菜IRT1基因是ZIP家族的一员,具有转运二价金属离子功能,将基因在GenBank中注册,序列号为:GU363501,命名为AmIRT1