DNA条形码揭示日本纺织娘(Mecopoda niponensis)个体内和个体间的序列变异

摘要 采用DNA条形码通用引物对分布于我国的两种纺织娘14个个体进行了扩增与测定。结果显示，6个纺织娘Mecopoda elongata个体均可由PCR产物直接测序法获得良好测序结果，序列长度均为658 bp，且不存在碱基插入/缺失。而8个日本纺织娘M. niponensis个体PCR法直接测序结果峰图杂乱，软件无法识别，后经克隆法测定的85条克隆序列长度为580-662 bp，其中，20条为明显的线粒体假基因(Nuclear sequences of mitochondrial origin，numts)，包括4条存在终止密码子，15条存在碱基插入/缺失，1条存在读码框摆动；38条为疑似numts(含≥2个非同义替换位点)。利用Kimura 2-parameter(K2P)模型计算遗传距离发现，两种纺织娘之间的遗传距离为0.077，纺织娘及日本纺织娘个体间的遗传距离分别为0-0.008及0.030-0.051，而日本纺织娘个体内克隆间的遗传距离则分别为0-0.143(含numts)及0-0.083(不含numts)。邻接法系统发育树聚类结果显示，纺织娘形成一个单系分支，自举值为99，而日本纺织娘的COI和numts序列则聚类形成多个分支，提示这些numts序列可能是线粒体COI多次向核内转移的结果