NaCl胁迫下黑果枸杞转录组测序分析

摘要 研究黑果枸杞在不同浓度盐胁迫下基因表达谱变化情况,为进一步研究黑果枸杞抗盐分子机制奠定研究基础。对0（CK）、50、250 mmol/L NaCl溶液胁迫的黑果枸杞组培苗的根和叶在胁迫时间为0、1、12 h时分别取样,采用转录组测序（RNA-Seq）技术进行测序分析。结果表明,转录组测序共产生 222.49 Gb 原始数据,拼接出 Unigenes 86 037条,注释到 7大功能数据库（GO、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot和egg NOG）上的 Unigenes 总数为46 594个,占总Unigenes 的54.76%,还有38 929个Unigenes在这些数据库中没有得到注释。通过 GO 分类和 KEGG Pathway 富集性分析,分别归于 51 个 GO 类别和 211条代谢途径。差异表达基因分析显示,黑果枸杞叶片和根的上调基因和下调基因数随着NaCl浓度的增大和处理时间的延长均呈增加趋势,叶片中的上调基因数（7 514）小于下调基因数（9 032）,根中的上调基因数（12 347）大于下调基因数（11 559）。在黑果枸杞盐胁迫下转录组中发现28 325个SSR位点,最多的为单核苷酸 SSR,占 70.47%。综合分析表明,黑果枸杞对盐胁迫的反应是一个多基因参与、多个生物过程协同调控的过程,基因表达量的变化可能是基因调控的主要方式