马铃薯StSnRK2.1基因克隆与生物信息学分析

摘要 SnRK2 基因对植物的逆境胁迫具有重要的调节作用，以马铃薯‘陇薯3 号’（Solanum tuberosum）为试材，采用 RT-PCR 方法从马铃薯试管苗中克隆得到1 个SnRK2.1 基因cDNA，命名为StSnRK2.1，提交GenBank 注册，注册号为JX280911。 通过生物信息学分析，该基因开放阅读框全长1 008 bp，编码335 个氨基酸。预测蛋白质分子量约为37.77 kD，等电点为5.37，蛋 白质二级结构预测α-螺旋42.39%，延伸链16.42%，β-折叠7.46%，无规卷曲33.73%，具有疏水性，为膜内蛋白。亚细胞定位显示 该基因出现在细胞质及微体中的可能性较大。肽链可能有7 处丝氨酸磷酸化位点，2 处苏氨酸磷酸化位点，以及3 处酪氨酸磷酸化 位点，因此推测该基因在植物抗逆中有重要的作用