牡丹WD40类转录因子基因PsWD40-1和PsWD40-2的分离与序列分析

摘要 利用已构建的牡丹‘洛阳红’花瓣转录组数据库，筛选得到2个与植物花青素苷合成WD40蛋白同源性较高的Unigene序列，分别命名为PsWD40-1和PsWD40-2。利用RT-PCR技术，设计特异性引物对PsWD40-1和PsWD40-2最大阅读框（ORF）序列进行扩增，测序结果表明PsWD40-1序列包含一个1 035 bp的ORF，编码一个344 aa的肽链；PsWD40-2序列包含一个1 032 bp的ORF，编码一个343 aa的肽链。牡丹PsWD40-1和PsWD40-2基因推测所编码蛋白序列均具有典型的WD40结构域。PsWD40-1蛋白序列与葡萄VvWDR2相似性为96%，PsWD40-2蛋白序列与葡萄VvWDR1相似性为87%。系统进化树分析发现，PsWD40-1与葡萄VvWDR2、拟南芥AtAN11、陆地棉GhTTG2等序列聚在MP1分支，而PsWD40-2与葡萄VvWDR1、矮牵牛PhAN11、紫苏PfWD40等序列聚在另一分支TTG1/PAC1分支