GC夹对三种食源性致病菌的rpoB-PCR-DGGE图谱的影响

摘要 旨在探讨不同的GC夹以及GC夹连接引物的不同位置对3种食源性致病菌的DGGE图谱结果的影响，合成6对RNA聚合酶β亚基编码基因rpoB引物（rpoB 1-6），含3种不同GC夹（GC-1，GC-2，GC-3），且每种GC夹分别连接于正反引物5'端。应用rpoB-PCR-DGGE 对副溶血性弧菌（5株），单增李斯特菌（5株）和沙门氏菌（3株）进行分析，并与V3-PCR-DGGE和ERIC-PCR的图谱及聚类分析结果进行比较。结果显示，GC-3夹连接于反引物上的rpoB-PCR-DGGE分辨效果最好，分辨力指数达0.9，与ERIC-PCR相同，高于V3-PCR-DGGE。GC夹序列和连接引物位置均对rpoB-PCR-DGGE图谱结果产生影响。选择或设计无连续鸟嘌呤（G）排列的GC夹序列且将其连接于反引物5'端，均能有效提高rpoB-PCR-DGGE对食源性致病菌检测与分型的效果